茶树AMP脱氨酶基因SSR分子标记引物及应用

茶树AMP脱氨酶基因SSR分子标记引物及应用

发明专利

广西壮族自治区亚热带作物研究所(广西亚热带农产品加工研究所)

彭靖茹、张芬、冯春梅、黄寿辉、甘志勇、温立香、陈家献、袁冬寅、檀业维、李建强、黎新荣

2024年6月7日

证书号：第7076

365号；专利号ZL 202011148432.9

咖啡碱是茶叶中的重要成分。腺嘌呤是茶树中合成咖啡碱效率最高的前体物质。AMP 脱氨酶是一种氨基水解酶，它能够在一定条件下脱去腺苷酸嘌呤碱基上的氨基，生成 IMP 和 NH3，而且此催化反应不可逆。该酶具有分化的 N 端和保守的 C 端。N 端决定了不同物种中该酶的特异性，C 端则决定了该酶的专有性。目前针对发茶树AMP脱氨酶基因开相应的SSR分子标记并开展遗传多态性的应用研究未见报道。本发明通过下载AMP脱氨酶基因组序列，运用SSR search软件寻找其SSR标利用primer3进行引物设计,获得与AMP脱氨酶基因相关的9对SSR分子标记引物。通过PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选，筛选获得了4对多态性好、主带清晰的SSR引物，其中2对位于基因间于内含子区域，1对位于基因间区，1对位于 5’端非编码区（UTR5）。并应用于72份茶树种质资源遗传多态性的研究。本发明所获得的SSR分子标记可以用在茶树等植物种质资源的鉴定、遗传多样性的研究、遗传图谱的构建、种子纯度鉴定、种群的亲缘关系及演化或遗传育种等方面。