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广西热作所在中科院二区TOP期刊发表木薯叶绿体基因组系统发育与演化的研究论文
广西热作所亚热带果蔬安全控制重点实验室联合广西木薯研究所在《BMC Plant Biology》(中科院2区TOP,IF=4.8)发表了题为“Comprehensive analysis of 385 chloroplast genomes unveils phylogenetic relationships and evolutionary history in cassava”的研究论文。
图 1论文首页截图
木薯作为热带亚热带地区重要的粮食和经济作物,其栽培品种资源丰富但叶绿体基因组(CPGs)研究相对滞后,严重制约了对其母系遗传背景的深入解析。该研究成功组装了385个木薯品种的CPGs并对其特征进行了系统解析。系统发育分析将385个品种明确划分为4个演化分支,且与48个单倍型的聚类结果完全一致。研究鉴定了3个CPG高变区,实现了仅需6,645 bp的特征序列即可将385个品种高效划分为4个演化分支。此外,每个分支均存在与其他三个分支不同的插入-缺失(InDel)变异特征和简单重复序列(SSR)特征,该研究突破了传统形态学鉴定的局限性。以上研究成果为木薯种质资源评价、遗传改良和分子育种实践提供了重要的理论基础和技术支撑。
图2. 385个木薯叶绿体基因组最大似然树和单倍型网络
广西热作所曲俊儒、付海天、赵英为论文共同第一作者,孟开开为通讯作者。本研究获得广西农业科学院基本科研业务专项等项目的资助。
热作所 曲俊儒供稿/供图
一审一校:孟开开
二审二校:刘思朝
三审三校:覃剑峰